Auch Christine und Dietrich Bonhoeffer verloren nie den Kontakt zu einander. Dies wurde durch den engen Zusammenhalt in der Familie gefördert und zudem lebte sie mit ihrer Familie in nächster Nachbarschaft zum Elternhaus. Darüber hinaus gehörten Hans von Dohnanyi und sie zu dem Familienmitgliedern, die Dietrich Bonhoeffer auch im Predigerseminar Finkenwalde besuchten.

Auch wenn sie keine entsprechende politische Stellung hatte, war Christine von Dohnanyi durch Dietrich Bonhoeffer und ihren Mann über die Pläne der Widerstandsorganisation gut informiert. Dies machte sie einerseits zu einer guten Gesprächspartnerin, andererseits aber auch interessant für die Gestapo, die nicht nur Hans von Dohnanyi und Bonhoeffer, sondern zunächst auch Christine von Dohnanyi verhaftete. Im Gefängnis war sie darauf angewiesen, dass andere Familienmitglieder ihr halfen, weiterhin mit Dietrich bonhoeffer zu kommunizieren. Noch aus dem Gefängnis heraus bemühte sie sich darum, Mitglieder des Widerstandes zu entlasten und Spuren im Sand verlaufen zu lassen.

Nach ihrer Freilassung versuchte sie weiterhin einen guten Einblick in die Ermittlungen zu haben und unter den Gefangenen zu vermitteln. – Trotz dieser Versuche konnte sie jedoch keine Freilassung für ihren Mann oder Dietrich Bonhoeffer erreichen. Während sie Hans von Dohnayi vor seiner letzten Verlegung noch ein Mal besuchen durfte, sah sie ihren Bruder nicht mehr wieder.